景观水处理中的沿岸带是恢复水生植被的核心区，也是蓝藻水华聚集的场所。蓝藻水华能降低湖水的透光率，减少水下可供水生植物利用的光资源；同时蓝藻能黏附在水生植物表面，不仅会严重妨碍光合作用和水生植物与湖水间的物质交换，还能招致微生物的大量繁殖，严重时会引起水生植物的腐烂死亡。
蓝藻水化的控制可以采取两种方式：一种是全湖性控制，即对全湖蓝藻总量进行控制，防止在沿岸带形成蓝藻聚集，在小型湖泊中比较容易实现；另一种是局部湖区的蓝藻控制，利用围隔技术将需要恢复水生植被的湖区与大湖面隔离开来，在隔离区内控制蓝藻，在大型湖泊中采取这种方式比较合理。
景观水处理中蓝藻的控制技术通过有机机梭捕捞、生物控制、药物控制等，如何经济有效地使用这些技术可视具体情况确定，比如在娱乐型城市景观水处理中采用药物控制可能会更快捷，但必须保证所使用的药物不会妨碍水生植物的生长和水生动物的生存。
