目前世界各地有8000多家使用紫外线消毒器水处理工艺的城市污水处理厂和自来水厂，而这一数据也在不断刷新，这与紫外消毒技术的自身优势是分不开的。在我国的一些水厂已经大部分开始接纳紫外线消毒器消毒技术，我国的紫外线消毒器杀菌消毒技术处于快速发展阶段。
一直以来，在几种常见消毒方式中，人们习惯于将氯消毒和紫外消毒进行比较。据业内人士分析，传统的氯消毒的成本一般是0.5～1分钱/吨水，而紫外的成本也就１分钱/吨水左右，有一定的可比性。而随着紫外灯管的寿命的延长和设备的不断优化，成本基本不再是困扰紫外线杀菌器消毒应用的问题了。
紫外线消毒器能较经济有效地解决两虫（隐孢子虫、贾第虫）问题。国外一般采用生饮水，水中隐孢子虫的存在、人们对水安全认识的提高以及有关水质标准的制定成为近几年紫外线杀菌器消毒在市政饮用水厂得到大规模应用的主要原因（紫外可以杀死隐孢子虫），中国目前新的水质标准也已将隐孢子虫和贾第虫列入。
此外，紫外消毒在控制消毒副产物和保证安全性方面有较大的优势。消毒副产物对人体的危害比较大，如三卤甲烷、卤乙酸以及嗅酸盐等是致癌物，而事实上水中实际存在的消毒副产物比标准中规定的副产物要多很多。
在世界范围内，紫外在水处理领域应用的历史很早，70年代以前由于紫外消毒技术不够成熟限制了紫外线的大规模应用。80年代后紫外逐渐成熟并在污水和自来水领域得到较快地应用，如规模为820万m3／d的纽约自来水厂，因为水源水质非常好，只简单经过沉淀、消毒后就向用户供水了。93年美国城市隐孢子虫爆发，因为没有过滤工艺，纽约自来水公司经过经济对比，选择了紫外线杀菌器消毒来应对隐孢子虫和预期更为严格的水质标准。除了纽约，华盛顿特区还有一个规模为100万m3／d的水厂采用了紫外线消毒器消毒。
我国的一些水厂已经开始接纳紫外线消毒技术，我国的紫外线消毒器杀菌消毒技术处于快速发展阶段，许多企业和单位对紫外线消毒技术认识不足甚至存在一些误区，对这一技术的了解和掌握不够系统和全面，特别是有些购买方在不了解紫外消毒技术和设备的情况下，过于追求降低紫外线消毒器成本而忽视了设备的性能和质量问题，设备运行和使用可能会出现一些问题，让一个很好的技术在中国失去用户的信心。
在目前众多消毒技术当中，没有一种理想的单一消毒手段，任何技术都有优缺点，如：氯消毒的安全性问题主要体现在消毒副产物和使用环节中的安全性以及无法有效控制隐孢子虫等病原体、臭氧存在嗅酸盐问题以及经济性问题、紫外线杀菌器虽然公认在所有消毒手段中对微生物具有广谱性，可以很经济范围内控制隐孢子虫但对线病毒消毒不是很经济，另外在饮用水处理中无法保证管网生物稳定性等。
应该结合不同的水质、水源条件，采取多屏障的消毒措施，来保证饮用水消毒的安全性。将多种消毒手段结合起来使用，取长补短。另外紫外线消毒器消毒+双氧水的深度氧化技术对微污染控制包括藻毒素等有很好的效果，而且在北美、欧洲等地已经有很成功的工程案例。
鉴于紫外消毒自身的特点，加上国内水质标准的不断提高，紫外线消毒已经赢得了一席之地。紫外线杀菌器消毒技术应用比较广泛，城市污水、市政饮用水、工业/商业用水、住宅区生活用水、水中环境污染物处理等领域，而且随着对消毒性能、节能、运行成本上的不断深入研究和创新，紫外线消毒器消毒会有更广泛的应用。
